رئیس مجلس شورای اسلامی با تسلیت درگذشت آیتالله محفوظی گفت که آیتالله محفوظی از شاگردان و همراهان امامخمینی(ره) در دوران مبارزات نهضت اسلامی بودند که بهدلیل حضور فعال خود بارها دستگیر و زندانی شدند و پس از انقلاب نیز در زمره خدمتگزاران متعهد و صدیق قرار داشتند.
در بخشی از پیام تسلیت مجمع نمایندگان مردم اصفهان در مجلس خبرگان رهبری، در پی ارتحال آیتالله ناصری آمده است: از توفیقات این عالم بزرگ خدمات اجتماعی، تأسیس مراکز علمی، مراکز بهداشتی و رسیدگی به محرومان بود.
حضرت آیتالله خامنهای در پیامی ضمن تسلیت درگذشت آیتالله محمدعلی ناصری فرمودند: این عالم بزرگوار و معلّم اخلاق، وظیفه بزرگ تزکیه و نشر معارف اخلاقی اسلام را تکلیف خویش میدانست.