هنأ السيد علي فضل الله الرئيس المصري الجديد محمد مرسي بفوزه قائلاً " نجاحكم المنتظر في قيادة دفة السفينة المصرية نحو برّ الأمان كما هو متوقع ومنتظر، سيكون دليلاً إضافياً يؤكد قدرة الإسلام على تقديم الحلول الناجحة والناجعة للمشاكل المعاصرة على الصعد الاجتماعية والاقتصادية والسياسية والإدارية وغيرها". 

وفيما يتعلق بالقضية الفلسطينية وما لها من إرتباط بالسياسة المصرية دعا السيد فضل الله الرئيس المصري "لنصرة القضية الفلسطينية وإعادة الزخم لها وحركتها على المستويات العربية والإسلامية".

كما أضاف السيد علي فضل الله في برقية إلى مرسي قائلاً " "كان لفوزكم أثرٌ إيجابيٌ مباشر على الساحتين الإسلامية والعربية، بالنظر الى الصورة التي عكسها هذا الفوز، لكونه المؤشر لنجاح الإسلاميين في إدارة الحكم في بلد عربي عزيز وكبير كمصر، الأمر الذي سيترك تداعياته الايجابية على المنطقة العربية والاسلامية بأسرها ان شاء الله تعالى". 

وفي حين أكد السيد فضل الله على هذا الفوز وعلى الرسالة التي سيبعث بها الى كل الآفاق والى الداخل العربي والإسلامي وخارجه"، أعرب السيد فضل الله عن أمله في أن "يكون لهذا الفوز آثاره الحاسمة في حفظ الساحة الإسلامية خصوصاً في العالم العربي وحفظ مسيرة الوحدة الإسلامية وقطع الطريق على المشاريع الخارجية الساعية للإيقاع بين السنة والشيعة". 

كذلك تمنى السيد فضل الله أن تنجح سياسة مصر الجديدة في مواجهة سياسة التفتيت وتمزيق الأمة بعد إدخالها في فتنة مذهبية عمل لها الأعداء وتسعى لها الدوائر الإعلامية المعادية في كل يوم".